Karierę na rynku finansowym rozpoczęła od stanowiska specjalisty ds. rynku terminowego (Warszawska Giełda Towarowa). Następnie piastowała stanowisko maklera papierów wartościowych (Wood and Company, Credit Suisse First Boston) oraz menedżera projektów strategicznych (DM BZWBK).

W Grupie innogy pracuje od 2004 roku. Zajmowała szereg stanowisk menedżerskich w obszarach: Finanse, Zakupy Energii, Kontroling i Zarządzanie Ryzykiem. Od 2013 roku obejmowała funkcje międzynarodowe w spółkach należących do Grupy innogy w Niemczech. W RWE Generation kierowała działem Asset Controlling, gdzie była odpowiedzialna za kontroling elektrowni jądrowych, węglowych oraz kopalni w Niemczech, Wielkiej Brytanii i Holandii. W 2014 roku objęła kierownictwo działu kontrolingu w spółce sprzedażowej RWE Vertrieb z siedzibą w Dortmundzie.

Joanna Kępczyńska jest absolwentką SGH na kierunku Finanse i Bankowość, a także studiów MBA na Politechnice Warszawskiej realizowanych we współpracy z HEC Paris Graduate Business School. Ukończyła także London Business School oraz Norwegian School of Economics and Business Administration.